Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.3 ms