Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTNNA2P26232 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms