Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms