Protein–RNA interactions for Protein: P24046

GABRR1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-1, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR1P24046 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRR1P24046 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms