Protein–RNA interactions for Protein: P22415

USF1, Upstream stimulatory factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1P22415 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15□□□□□ -0.01
USF1P22415 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USF1P22415 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
USF1P22415 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
USF1P22415 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
USF1P22415 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USF1P22415 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USF1P22415 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USF1P22415 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USF1P22415 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USF1P22415 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USF1P22415 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USF1P22415 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USF1P22415 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USF1P22415 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USF1P22415 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USF1P22415 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USF1P22415 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USF1P22415 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USF1P22415 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USF1P22415 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USF1P22415 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USF1P22415 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USF1P22415 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
USF1P22415 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
USF1P22415 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USF1P22415 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
USF1P22415 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USF1P22415 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
USF1P22415 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USF1P22415 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USF1P22415 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USF1P22415 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USF1P22415 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USF1P22415 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USF1P22415 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USF1P22415 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USF1P22415 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USF1P22415 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USF1P22415 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
USF1P22415 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USF1P22415 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USF1P22415 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USF1P22415 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USF1P22415 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USF1P22415 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USF1P22415 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
USF1P22415 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
USF1P22415 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
USF1P22415 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
USF1P22415 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
USF1P22415 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
USF1P22415 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
USF1P22415 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
USF1P22415 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
USF1P22415 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
USF1P22415 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
USF1P22415 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
USF1P22415 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
USF1P22415 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
USF1P22415 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
USF1P22415 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
USF1P22415 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
USF1P22415 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
USF1P22415 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
USF1P22415 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
USF1P22415 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
USF1P22415 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
USF1P22415 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
USF1P22415 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
USF1P22415 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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USF1P22415 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
USF1P22415 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
USF1P22415 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
USF1P22415 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
USF1P22415 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
USF1P22415 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
USF1P22415 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
USF1P22415 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
USF1P22415 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
USF1P22415 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
USF1P22415 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USF1P22415 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USF1P22415 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USF1P22415 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USF1P22415 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
USF1P22415 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USF1P22415 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USF1P22415 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USF1P22415 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USF1P22415 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USF1P22415 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USF1P22415 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USF1P22415 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USF1P22415 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USF1P22415 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USF1P22415 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USF1P22415 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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