Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms