Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP4AP20648 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP4AP20648 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP4AP20648 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATP4AP20648 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATP4AP20648 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATP4AP20648 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATP4AP20648 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATP4AP20648 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATP4AP20648 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATP4AP20648 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATP4AP20648 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATP4AP20648 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
ATP4AP20648 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP4AP20648 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms