Protein–RNA interactions for Protein: P20337

RAB3B, Ras-related protein Rab-3B, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3BP20337 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB3BP20337 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms