Protein–RNA interactions for Protein: P20142

PGC, Gastricsin, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGCP20142 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGCP20142 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGCP20142 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGCP20142 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGCP20142 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGCP20142 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGCP20142 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGCP20142 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGCP20142 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGCP20142 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGCP20142 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGCP20142 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGCP20142 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGCP20142 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGCP20142 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGCP20142 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGCP20142 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGCP20142 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGCP20142 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGCP20142 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGCP20142 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGCP20142 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGCP20142 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGCP20142 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGCP20142 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGCP20142 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGCP20142 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGCP20142 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PGCP20142 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGCP20142 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PGCP20142 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGCP20142 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PGCP20142 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGCP20142 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PGCP20142 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGCP20142 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGCP20142 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGCP20142 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PGCP20142 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGCP20142 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGCP20142 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGCP20142 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGCP20142 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGCP20142 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGCP20142 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGCP20142 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGCP20142 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGCP20142 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGCP20142 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGCP20142 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGCP20142 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGCP20142 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGCP20142 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGCP20142 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGCP20142 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGCP20142 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGCP20142 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGCP20142 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGCP20142 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGCP20142 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PGCP20142 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGCP20142 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGCP20142 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGCP20142 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGCP20142 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGCP20142 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGCP20142 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGCP20142 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGCP20142 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGCP20142 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGCP20142 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGCP20142 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGCP20142 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGCP20142 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGCP20142 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PGCP20142 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGCP20142 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGCP20142 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGCP20142 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PGCP20142 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGCP20142 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGCP20142 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGCP20142 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGCP20142 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGCP20142 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGCP20142 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGCP20142 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGCP20142 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGCP20142 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGCP20142 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGCP20142 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGCP20142 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGCP20142 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PGCP20142 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGCP20142 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGCP20142 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGCP20142 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGCP20142 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGCP20142 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGCP20142 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms