Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD53P19397 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD53P19397 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD53P19397 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD53P19397 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD53P19397 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD53P19397 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD53P19397 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD53P19397 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD53P19397 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD53P19397 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD53P19397 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD53P19397 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD53P19397 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD53P19397 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD53P19397 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD53P19397 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD53P19397 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD53P19397 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CD53P19397 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD53P19397 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD53P19397 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD53P19397 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD53P19397 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD53P19397 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CD53P19397 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD53P19397 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD53P19397 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD53P19397 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD53P19397 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD53P19397 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD53P19397 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD53P19397 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD53P19397 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD53P19397 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD53P19397 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD53P19397 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD53P19397 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD53P19397 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD53P19397 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD53P19397 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD53P19397 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD53P19397 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD53P19397 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD53P19397 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD53P19397 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD53P19397 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD53P19397 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD53P19397 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD53P19397 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD53P19397 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD53P19397 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD53P19397 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD53P19397 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD53P19397 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD53P19397 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD53P19397 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD53P19397 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD53P19397 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD53P19397 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CD53P19397 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD53P19397 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD53P19397 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD53P19397 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD53P19397 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD53P19397 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD53P19397 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD53P19397 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD53P19397 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD53P19397 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD53P19397 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD53P19397 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD53P19397 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD53P19397 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD53P19397 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD53P19397 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD53P19397 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD53P19397 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD53P19397 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD53P19397 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD53P19397 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD53P19397 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD53P19397 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD53P19397 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD53P19397 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD53P19397 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD53P19397 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD53P19397 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD53P19397 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD53P19397 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD53P19397 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD53P19397 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD53P19397 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD53P19397 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD53P19397 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD53P19397 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD53P19397 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD53P19397 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD53P19397 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD53P19397 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms