Protein–RNA interactions for Protein: P18846

ATF1, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF1P18846 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATF1P18846 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATF1P18846 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATF1P18846 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATF1P18846 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATF1P18846 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATF1P18846 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATF1P18846 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATF1P18846 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATF1P18846 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATF1P18846 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATF1P18846 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATF1P18846 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATF1P18846 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATF1P18846 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATF1P18846 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATF1P18846 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATF1P18846 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATF1P18846 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATF1P18846 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATF1P18846 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATF1P18846 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATF1P18846 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATF1P18846 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATF1P18846 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATF1P18846 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATF1P18846 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATF1P18846 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATF1P18846 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATF1P18846 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATF1P18846 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATF1P18846 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATF1P18846 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATF1P18846 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATF1P18846 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATF1P18846 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATF1P18846 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATF1P18846 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATF1P18846 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATF1P18846 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATF1P18846 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATF1P18846 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATF1P18846 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATF1P18846 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATF1P18846 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATF1P18846 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATF1P18846 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATF1P18846 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATF1P18846 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATF1P18846 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATF1P18846 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATF1P18846 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATF1P18846 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATF1P18846 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATF1P18846 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATF1P18846 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATF1P18846 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATF1P18846 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATF1P18846 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATF1P18846 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATF1P18846 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATF1P18846 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATF1P18846 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATF1P18846 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATF1P18846 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATF1P18846 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATF1P18846 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATF1P18846 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATF1P18846 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATF1P18846 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATF1P18846 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATF1P18846 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATF1P18846 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATF1P18846 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATF1P18846 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATF1P18846 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATF1P18846 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATF1P18846 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATF1P18846 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATF1P18846 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATF1P18846 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATF1P18846 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATF1P18846 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATF1P18846 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATF1P18846 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATF1P18846 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATF1P18846 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATF1P18846 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATF1P18846 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATF1P18846 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATF1P18846 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATF1P18846 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATF1P18846 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATF1P18846 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATF1P18846 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATF1P18846 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATF1P18846 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATF1P18846 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATF1P18846 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATF1P18846 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms