Protein–RNA interactions for Protein: P18577

RHCE, Blood group Rh(CE) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHCEP18577 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RHCEP18577 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RHCEP18577 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RHCEP18577 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RHCEP18577 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RHCEP18577 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RHCEP18577 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RHCEP18577 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RHCEP18577 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RHCEP18577 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RHCEP18577 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RHCEP18577 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RHCEP18577 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RHCEP18577 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RHCEP18577 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RHCEP18577 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RHCEP18577 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RHCEP18577 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RHCEP18577 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RHCEP18577 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RHCEP18577 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RHCEP18577 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RHCEP18577 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RHCEP18577 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RHCEP18577 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RHCEP18577 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RHCEP18577 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RHCEP18577 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RHCEP18577 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RHCEP18577 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RHCEP18577 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RHCEP18577 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RHCEP18577 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RHCEP18577 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RHCEP18577 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RHCEP18577 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RHCEP18577 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RHCEP18577 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RHCEP18577 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RHCEP18577 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RHCEP18577 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHCEP18577 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHCEP18577 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHCEP18577 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHCEP18577 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RHCEP18577 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHCEP18577 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHCEP18577 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHCEP18577 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHCEP18577 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHCEP18577 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHCEP18577 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHCEP18577 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHCEP18577 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHCEP18577 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHCEP18577 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHCEP18577 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHCEP18577 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHCEP18577 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHCEP18577 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHCEP18577 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHCEP18577 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHCEP18577 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHCEP18577 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHCEP18577 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHCEP18577 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHCEP18577 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHCEP18577 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHCEP18577 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHCEP18577 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHCEP18577 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHCEP18577 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHCEP18577 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHCEP18577 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHCEP18577 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHCEP18577 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHCEP18577 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHCEP18577 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHCEP18577 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHCEP18577 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHCEP18577 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHCEP18577 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHCEP18577 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHCEP18577 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHCEP18577 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHCEP18577 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHCEP18577 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHCEP18577 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RHCEP18577 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHCEP18577 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RHCEP18577 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHCEP18577 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHCEP18577 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHCEP18577 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHCEP18577 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHCEP18577 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHCEP18577 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHCEP18577 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHCEP18577 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHCEP18577 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms