Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
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