Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD46P15529 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD46P15529 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD46P15529 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD46P15529 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD46P15529 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CD46P15529 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CD46P15529 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CD46P15529 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CD46P15529 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD46P15529 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD46P15529 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD46P15529 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD46P15529 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CD46P15529 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CD46P15529 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD46P15529 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CD46P15529 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CD46P15529 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD46P15529 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD46P15529 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD46P15529 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD46P15529 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD46P15529 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CD46P15529 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD46P15529 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD46P15529 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD46P15529 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD46P15529 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD46P15529 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD46P15529 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD46P15529 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD46P15529 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD46P15529 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD46P15529 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD46P15529 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD46P15529 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD46P15529 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD46P15529 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD46P15529 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CD46P15529 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD46P15529 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD46P15529 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD46P15529 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CD46P15529 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD46P15529 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD46P15529 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CD46P15529 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD46P15529 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD46P15529 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD46P15529 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CD46P15529 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CD46P15529 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD46P15529 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD46P15529 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD46P15529 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD46P15529 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD46P15529 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD46P15529 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD46P15529 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD46P15529 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD46P15529 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD46P15529 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD46P15529 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD46P15529 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD46P15529 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD46P15529 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD46P15529 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD46P15529 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD46P15529 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD46P15529 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD46P15529 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CD46P15529 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD46P15529 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD46P15529 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CD46P15529 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CD46P15529 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD46P15529 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD46P15529 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD46P15529 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD46P15529 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD46P15529 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CD46P15529 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD46P15529 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CD46P15529 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD46P15529 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD46P15529 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CD46P15529 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD46P15529 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD46P15529 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD46P15529 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD46P15529 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD46P15529 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD46P15529 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD46P15529 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD46P15529 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD46P15529 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD46P15529 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD46P15529 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CD46P15529 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms