Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXB3P14651 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms