Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM27P14373 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms