Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRF1P14222 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRF1P14222 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRF1P14222 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRF1P14222 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PRF1P14222 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRF1P14222 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRF1P14222 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRF1P14222 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRF1P14222 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRF1P14222 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRF1P14222 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRF1P14222 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRF1P14222 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRF1P14222 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRF1P14222 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRF1P14222 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRF1P14222 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PRF1P14222 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRF1P14222 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRF1P14222 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRF1P14222 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRF1P14222 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRF1P14222 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRF1P14222 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRF1P14222 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRF1P14222 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRF1P14222 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRF1P14222 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRF1P14222 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRF1P14222 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRF1P14222 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRF1P14222 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRF1P14222 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRF1P14222 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRF1P14222 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRF1P14222 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRF1P14222 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRF1P14222 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRF1P14222 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRF1P14222 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRF1P14222 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRF1P14222 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRF1P14222 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRF1P14222 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRF1P14222 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRF1P14222 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRF1P14222 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRF1P14222 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRF1P14222 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PRF1P14222 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRF1P14222 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRF1P14222 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRF1P14222 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PRF1P14222 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRF1P14222 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRF1P14222 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRF1P14222 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRF1P14222 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRF1P14222 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRF1P14222 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRF1P14222 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
PRF1P14222 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRF1P14222 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRF1P14222 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRF1P14222 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PRF1P14222 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRF1P14222 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRF1P14222 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PRF1P14222 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRF1P14222 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRF1P14222 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRF1P14222 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRF1P14222 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRF1P14222 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRF1P14222 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRF1P14222 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRF1P14222 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRF1P14222 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRF1P14222 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRF1P14222 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRF1P14222 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRF1P14222 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRF1P14222 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRF1P14222 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRF1P14222 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PRF1P14222 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRF1P14222 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRF1P14222 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRF1P14222 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PRF1P14222 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRF1P14222 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRF1P14222 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRF1P14222 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRF1P14222 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRF1P14222 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRF1P14222 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRF1P14222 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRF1P14222 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRF1P14222 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms