Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms