Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MS4A1P11836 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms