Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GLI3P10071 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GLI3P10071 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GLI3P10071 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GLI3P10071 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GLI3P10071 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GLI3P10071 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GLI3P10071 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GLI3P10071 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GLI3P10071 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GLI3P10071 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GLI3P10071 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GLI3P10071 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GLI3P10071 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GLI3P10071 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GLI3P10071 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GLI3P10071 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GLI3P10071 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GLI3P10071 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GLI3P10071 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GLI3P10071 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GLI3P10071 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GLI3P10071 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GLI3P10071 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GLI3P10071 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GLI3P10071 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GLI3P10071 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GLI3P10071 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GLI3P10071 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GLI3P10071 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GLI3P10071 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GLI3P10071 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GLI3P10071 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GLI3P10071 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GLI3P10071 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GLI3P10071 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GLI3P10071 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GLI3P10071 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GLI3P10071 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GLI3P10071 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GLI3P10071 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GLI3P10071 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GLI3P10071 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GLI3P10071 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GLI3P10071 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GLI3P10071 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GLI3P10071 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GLI3P10071 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GLI3P10071 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GLI3P10071 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GLI3P10071 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GLI3P10071 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GLI3P10071 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GLI3P10071 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GLI3P10071 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GLI3P10071 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLI3P10071 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLI3P10071 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLI3P10071 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLI3P10071 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLI3P10071 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLI3P10071 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLI3P10071 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLI3P10071 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLI3P10071 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLI3P10071 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLI3P10071 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLI3P10071 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLI3P10071 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GLI3P10071 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLI3P10071 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLI3P10071 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GLI3P10071 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLI3P10071 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLI3P10071 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLI3P10071 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLI3P10071 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLI3P10071 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GLI3P10071 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GLI3P10071 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GLI3P10071 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GLI3P10071 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GLI3P10071 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GLI3P10071 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GLI3P10071 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GLI3P10071 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GLI3P10071 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GLI3P10071 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GLI3P10071 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GLI3P10071 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GLI3P10071 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GLI3P10071 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GLI3P10071 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GLI3P10071 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GLI3P10071 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GLI3P10071 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GLI3P10071 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GLI3P10071 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GLI3P10071 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GLI3P10071 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms