Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC22■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC22■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C4AP0C0L4 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms