Protein–RNA interactions for Protein: P08648

ITGA5, Integrin alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA5P08648 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ITGA5P08648 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ITGA5P08648 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ITGA5P08648 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ITGA5P08648 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA5P08648 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA5P08648 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA5P08648 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA5P08648 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA5P08648 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA5P08648 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA5P08648 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA5P08648 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA5P08648 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA5P08648 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA5P08648 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA5P08648 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA5P08648 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA5P08648 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA5P08648 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA5P08648 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA5P08648 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA5P08648 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA5P08648 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA5P08648 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA5P08648 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA5P08648 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA5P08648 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA5P08648 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA5P08648 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA5P08648 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA5P08648 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA5P08648 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA5P08648 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA5P08648 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA5P08648 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA5P08648 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA5P08648 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA5P08648 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA5P08648 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA5P08648 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA5P08648 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA5P08648 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA5P08648 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA5P08648 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA5P08648 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA5P08648 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA5P08648 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA5P08648 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA5P08648 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA5P08648 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA5P08648 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA5P08648 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA5P08648 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA5P08648 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA5P08648 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA5P08648 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA5P08648 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA5P08648 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA5P08648 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA5P08648 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA5P08648 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA5P08648 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA5P08648 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA5P08648 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA5P08648 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA5P08648 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA5P08648 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA5P08648 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA5P08648 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA5P08648 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA5P08648 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA5P08648 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA5P08648 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA5P08648 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA5P08648 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA5P08648 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA5P08648 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms