Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NGFRP08138 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NGFRP08138 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NGFRP08138 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NGFRP08138 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NGFRP08138 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NGFRP08138 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NGFRP08138 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NGFRP08138 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NGFRP08138 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NGFRP08138 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NGFRP08138 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NGFRP08138 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NGFRP08138 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NGFRP08138 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NGFRP08138 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NGFRP08138 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NGFRP08138 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NGFRP08138 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NGFRP08138 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NGFRP08138 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NGFRP08138 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NGFRP08138 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NGFRP08138 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NGFRP08138 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NGFRP08138 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NGFRP08138 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NGFRP08138 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NGFRP08138 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NGFRP08138 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NGFRP08138 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NGFRP08138 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NGFRP08138 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NGFRP08138 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NGFRP08138 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NGFRP08138 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NGFRP08138 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NGFRP08138 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NGFRP08138 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NGFRP08138 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NGFRP08138 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NGFRP08138 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NGFRP08138 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NGFRP08138 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NGFRP08138 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NGFRP08138 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NGFRP08138 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NGFRP08138 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NGFRP08138 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NGFRP08138 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NGFRP08138 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NGFRP08138 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NGFRP08138 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NGFRP08138 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NGFRP08138 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NGFRP08138 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NGFRP08138 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NGFRP08138 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NGFRP08138 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NGFRP08138 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NGFRP08138 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NGFRP08138 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NGFRP08138 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NGFRP08138 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NGFRP08138 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NGFRP08138 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NGFRP08138 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NGFRP08138 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NGFRP08138 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NGFRP08138 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NGFRP08138 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NGFRP08138 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NGFRP08138 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NGFRP08138 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NGFRP08138 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NGFRP08138 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NGFRP08138 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NGFRP08138 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NGFRP08138 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NGFRP08138 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NGFRP08138 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NGFRP08138 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NGFRP08138 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NGFRP08138 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NGFRP08138 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NGFRP08138 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NGFRP08138 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NGFRP08138 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NGFRP08138 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NGFRP08138 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NGFRP08138 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NGFRP08138 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NGFRP08138 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NGFRP08138 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NGFRP08138 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NGFRP08138 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NGFRP08138 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NGFRP08138 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NGFRP08138 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NGFRP08138 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms