Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEFLP07196 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEFLP07196 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEFLP07196 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEFLP07196 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NEFLP07196 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEFLP07196 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEFLP07196 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEFLP07196 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEFLP07196 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NEFLP07196 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEFLP07196 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEFLP07196 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEFLP07196 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEFLP07196 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEFLP07196 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEFLP07196 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEFLP07196 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEFLP07196 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEFLP07196 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEFLP07196 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NEFLP07196 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEFLP07196 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEFLP07196 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEFLP07196 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEFLP07196 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEFLP07196 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEFLP07196 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEFLP07196 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEFLP07196 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEFLP07196 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEFLP07196 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEFLP07196 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEFLP07196 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEFLP07196 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEFLP07196 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEFLP07196 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEFLP07196 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEFLP07196 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEFLP07196 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEFLP07196 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEFLP07196 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEFLP07196 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEFLP07196 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEFLP07196 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEFLP07196 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEFLP07196 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
NEFLP07196 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEFLP07196 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEFLP07196 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEFLP07196 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEFLP07196 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEFLP07196 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEFLP07196 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEFLP07196 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NEFLP07196 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NEFLP07196 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEFLP07196 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEFLP07196 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEFLP07196 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NEFLP07196 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEFLP07196 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEFLP07196 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEFLP07196 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NEFLP07196 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEFLP07196 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEFLP07196 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEFLP07196 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEFLP07196 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEFLP07196 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEFLP07196 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEFLP07196 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEFLP07196 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEFLP07196 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEFLP07196 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEFLP07196 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEFLP07196 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEFLP07196 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEFLP07196 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEFLP07196 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEFLP07196 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEFLP07196 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEFLP07196 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEFLP07196 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEFLP07196 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEFLP07196 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEFLP07196 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NEFLP07196 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEFLP07196 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEFLP07196 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEFLP07196 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEFLP07196 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NEFLP07196 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEFLP07196 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEFLP07196 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEFLP07196 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEFLP07196 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEFLP07196 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEFLP07196 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEFLP07196 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms