Protein–RNA interactions for Protein: P04216

THY1, Thy-1 membrane glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THY1P04216 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
THY1P04216 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
THY1P04216 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
THY1P04216 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
THY1P04216 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
THY1P04216 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
THY1P04216 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
THY1P04216 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
THY1P04216 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
THY1P04216 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
THY1P04216 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
THY1P04216 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
THY1P04216 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
THY1P04216 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
THY1P04216 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
THY1P04216 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
THY1P04216 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
THY1P04216 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
THY1P04216 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
THY1P04216 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
THY1P04216 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
THY1P04216 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
THY1P04216 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
THY1P04216 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
THY1P04216 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
THY1P04216 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
THY1P04216 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
THY1P04216 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
THY1P04216 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
THY1P04216 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
THY1P04216 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
THY1P04216 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
THY1P04216 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
THY1P04216 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
THY1P04216 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
THY1P04216 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
THY1P04216 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
THY1P04216 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
THY1P04216 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
THY1P04216 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
THY1P04216 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
THY1P04216 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
THY1P04216 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
THY1P04216 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
THY1P04216 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
THY1P04216 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
THY1P04216 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
THY1P04216 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
THY1P04216 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
THY1P04216 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
THY1P04216 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
THY1P04216 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
THY1P04216 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
THY1P04216 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
THY1P04216 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
THY1P04216 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
THY1P04216 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
THY1P04216 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
THY1P04216 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
THY1P04216 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
THY1P04216 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
THY1P04216 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
THY1P04216 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
THY1P04216 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
THY1P04216 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
THY1P04216 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
THY1P04216 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
THY1P04216 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
THY1P04216 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
THY1P04216 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
THY1P04216 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
THY1P04216 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
THY1P04216 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
THY1P04216 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
THY1P04216 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
THY1P04216 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
THY1P04216 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
THY1P04216 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
THY1P04216 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
THY1P04216 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
THY1P04216 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
THY1P04216 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
THY1P04216 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
THY1P04216 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
THY1P04216 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
THY1P04216 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
THY1P04216 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
THY1P04216 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
THY1P04216 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
THY1P04216 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
THY1P04216 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
THY1P04216 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
THY1P04216 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
THY1P04216 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
THY1P04216 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
THY1P04216 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
THY1P04216 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
THY1P04216 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
THY1P04216 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
THY1P04216 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms