Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms