Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
POLR1AO95602 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms