Protein–RNA interactions for Protein: O75976

CPD, Carboxypeptidase D, humanhuman

Predictions only

Length 1,380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPDO75976 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPDO75976 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPDO75976 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CPDO75976 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPDO75976 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPDO75976 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPDO75976 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPDO75976 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPDO75976 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPDO75976 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPDO75976 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPDO75976 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPDO75976 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPDO75976 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPDO75976 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPDO75976 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPDO75976 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPDO75976 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPDO75976 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPDO75976 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPDO75976 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPDO75976 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CPDO75976 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CPDO75976 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPDO75976 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPDO75976 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPDO75976 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CPDO75976 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CPDO75976 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CPDO75976 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPDO75976 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPDO75976 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPDO75976 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPDO75976 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPDO75976 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPDO75976 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPDO75976 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPDO75976 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CPDO75976 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPDO75976 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPDO75976 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPDO75976 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPDO75976 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPDO75976 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPDO75976 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPDO75976 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPDO75976 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPDO75976 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPDO75976 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPDO75976 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CPDO75976 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPDO75976 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPDO75976 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPDO75976 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPDO75976 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPDO75976 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPDO75976 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPDO75976 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPDO75976 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPDO75976 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPDO75976 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPDO75976 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPDO75976 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPDO75976 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPDO75976 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPDO75976 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CPDO75976 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CPDO75976 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CPDO75976 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPDO75976 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPDO75976 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CPDO75976 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPDO75976 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPDO75976 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPDO75976 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPDO75976 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPDO75976 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPDO75976 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPDO75976 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPDO75976 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPDO75976 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPDO75976 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPDO75976 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPDO75976 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPDO75976 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPDO75976 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPDO75976 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPDO75976 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPDO75976 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPDO75976 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPDO75976 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPDO75976 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPDO75976 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CPDO75976 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CPDO75976 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPDO75976 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPDO75976 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPDO75976 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPDO75976 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPDO75976 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms