Protein–RNA interactions for Protein: O15524

SOCS1, Suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1O15524 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SOCS1O15524 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SOCS1O15524 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SOCS1O15524 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SOCS1O15524 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SOCS1O15524 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SOCS1O15524 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SOCS1O15524 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SOCS1O15524 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SOCS1O15524 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SOCS1O15524 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SOCS1O15524 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SOCS1O15524 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SOCS1O15524 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SOCS1O15524 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SOCS1O15524 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SOCS1O15524 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SOCS1O15524 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SOCS1O15524 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SOCS1O15524 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SOCS1O15524 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SOCS1O15524 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SOCS1O15524 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SOCS1O15524 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SOCS1O15524 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SOCS1O15524 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SOCS1O15524 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SOCS1O15524 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SOCS1O15524 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SOCS1O15524 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SOCS1O15524 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SOCS1O15524 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SOCS1O15524 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SOCS1O15524 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SOCS1O15524 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SOCS1O15524 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SOCS1O15524 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SOCS1O15524 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SOCS1O15524 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SOCS1O15524 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SOCS1O15524 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SOCS1O15524 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SOCS1O15524 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SOCS1O15524 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SOCS1O15524 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SOCS1O15524 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SOCS1O15524 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SOCS1O15524 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SOCS1O15524 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SOCS1O15524 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SOCS1O15524 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SOCS1O15524 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SOCS1O15524 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SOCS1O15524 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SOCS1O15524 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SOCS1O15524 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SOCS1O15524 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SOCS1O15524 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SOCS1O15524 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SOCS1O15524 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SOCS1O15524 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SOCS1O15524 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SOCS1O15524 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SOCS1O15524 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SOCS1O15524 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SOCS1O15524 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SOCS1O15524 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SOCS1O15524 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SOCS1O15524 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SOCS1O15524 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SOCS1O15524 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SOCS1O15524 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SOCS1O15524 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SOCS1O15524 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SOCS1O15524 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SOCS1O15524 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SOCS1O15524 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SOCS1O15524 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SOCS1O15524 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SOCS1O15524 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SOCS1O15524 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SOCS1O15524 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SOCS1O15524 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SOCS1O15524 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SOCS1O15524 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SOCS1O15524 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SOCS1O15524 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SOCS1O15524 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SOCS1O15524 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SOCS1O15524 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SOCS1O15524 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SOCS1O15524 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SOCS1O15524 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SOCS1O15524 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SOCS1O15524 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SOCS1O15524 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SOCS1O15524 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SOCS1O15524 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SOCS1O15524 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SOCS1O15524 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms