Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms