Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F3O00716 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F3O00716 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F3O00716 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F3O00716 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F3O00716 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F3O00716 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F3O00716 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F3O00716 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F3O00716 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F3O00716 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F3O00716 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F3O00716 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F3O00716 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F3O00716 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F3O00716 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F3O00716 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F3O00716 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F3O00716 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F3O00716 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F3O00716 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F3O00716 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F3O00716 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F3O00716 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F3O00716 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F3O00716 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F3O00716 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F3O00716 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F3O00716 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F3O00716 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F3O00716 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F3O00716 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F3O00716 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F3O00716 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F3O00716 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F3O00716 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F3O00716 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F3O00716 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F3O00716 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F3O00716 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F3O00716 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F3O00716 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F3O00716 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F3O00716 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F3O00716 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F3O00716 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F3O00716 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F3O00716 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F3O00716 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F3O00716 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F3O00716 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F3O00716 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F3O00716 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F3O00716 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F3O00716 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F3O00716 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F3O00716 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F3O00716 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F3O00716 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F3O00716 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F3O00716 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F3O00716 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F3O00716 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F3O00716 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F3O00716 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F3O00716 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F3O00716 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F3O00716 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F3O00716 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F3O00716 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F3O00716 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F3O00716 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F3O00716 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F3O00716 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F3O00716 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F3O00716 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F3O00716 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F3O00716 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F3O00716 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2F3O00716 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F3O00716 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F3O00716 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F3O00716 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F3O00716 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F3O00716 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F3O00716 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F3O00716 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F3O00716 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F3O00716 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F3O00716 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F3O00716 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F3O00716 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F3O00716 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F3O00716 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F3O00716 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F3O00716 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F3O00716 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F3O00716 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F3O00716 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F3O00716 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms