Protein–RNA interactions for Protein: O00421

CCRL2, C-C chemokine receptor-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCRL2O00421 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCRL2O00421 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms