Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms