Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SOBPA7XYQ1 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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