Protein–RNA interactions for Protein: A6NHT5

HMX3, Homeobox protein HMX3, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX3A6NHT5 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms