Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NEMP2A6NFY4 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEMP2A6NFY4 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEMP2A6NFY4 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEMP2A6NFY4 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEMP2A6NFY4 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEMP2A6NFY4 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEMP2A6NFY4 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEMP2A6NFY4 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NEMP2A6NFY4 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEMP2A6NFY4 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEMP2A6NFY4 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEMP2A6NFY4 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEMP2A6NFY4 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEMP2A6NFY4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEMP2A6NFY4 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEMP2A6NFY4 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEMP2A6NFY4 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEMP2A6NFY4 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEMP2A6NFY4 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEMP2A6NFY4 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEMP2A6NFY4 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEMP2A6NFY4 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEMP2A6NFY4 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms