Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms