Protein–RNA interactions for Protein: A6NE82

MBD3L3, Putative methyl-CpG-binding domain protein 3-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3L3A6NE82 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms