Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms