Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms