Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
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