Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms