Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms