Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
CLIP2Q9UDT6 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CLIP2Q9UDT6 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CLIP2Q9UDT6 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CLIP2Q9UDT6 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CLIP2Q9UDT6 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CLIP2Q9UDT6 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CLIP2Q9UDT6 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CLIP2Q9UDT6 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CLIP2Q9UDT6 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CLIP2Q9UDT6 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CLIP2Q9UDT6 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CLIP2Q9UDT6 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CLIP2Q9UDT6 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CLIP2Q9UDT6 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CLIP2Q9UDT6 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CLIP2Q9UDT6 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CLIP2Q9UDT6 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CLIP2Q9UDT6 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CLIP2Q9UDT6 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CLIP2Q9UDT6 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CLIP2Q9UDT6 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CLIP2Q9UDT6 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CLIP2Q9UDT6 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CLIP2Q9UDT6 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CLIP2Q9UDT6 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CLIP2Q9UDT6 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CLIP2Q9UDT6 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CLIP2Q9UDT6 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CLIP2Q9UDT6 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CLIP2Q9UDT6 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CLIP2Q9UDT6 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CLIP2Q9UDT6 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CLIP2Q9UDT6 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CLIP2Q9UDT6 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CLIP2Q9UDT6 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CLIP2Q9UDT6 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CLIP2Q9UDT6 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms