Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms