Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU7

DBF4, Protein DBF4 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBF4Q9UBU7 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms