Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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RNF7Q9UBF6 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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RNF7Q9UBF6 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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