Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms