Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms