Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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